Aspek kesehatan menjadi sangat penting dalam perhelatan PON Papua yang dilaksanakan pada situasi pandemi. Para atlet dan ofisial, serta seluruh orang yang terlibat wajib mengikuti protokol kesehatan agar pelaksanaan PON berlangsung aman dan sehat.
Pemeriksaan kesehatan dan validasi sertifikat vaksin dilakukan oleh petugas medis yang bersiap siaga selama pelaksanaan PON Papua. Salah satunya adalah dr. Rista Sitohang yang bertugas sebagai Penanggung Jawab Medis PON Papua. Pemeriksaan kesehatan dilakukan setelah kontingen tiba di tanah Papua serta sebelum mereka bertanding.
